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2012-02-16(Thu)

Rにgraphライブラリーをインストール





RMeCabを使ってグラフを作成しようとすると
> graph()
を実行すると「エラー graph()関数がみつかりません」となる。

graphライブラリーがインストールされてないようなのでインストールした。
ここに方法が記載されている。
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("graph")
BioC_mirror: 'http://www.bioconductor.org'
Using R version 2.14, BiocInstaller version 1.2.1.
Installing package(s) 'graph'
Installing package(s) into ‘C:/Users/keisuke/Documents/R/win-library/2.14’
(as ‘lib’ is unspecified)
URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.9/bioc/bin/windows/contrib/2.14/graph_1.32.0.zip' を試しています
Content type 'application/zip' length 1378862 bytes (1.3 Mb)
開かれた URL
downloaded 1.3 Mb

package ‘graph’ successfully unpacked and MD5 sums checked

The downloaded packages are in
C:\Users\hoge\AppData\Local\Temp\RtmpMRFtX7\downloaded_packages
警告メッセージ:
'boot' cannot be updated, installed directory 'C:/Program Files/R/R-2.14.1/library' not writeable
'cluster' cannot be updated, installed directory 'C:/Program Files/R/R-2.14.1/library' not writeable
'MASS' cannot be updated, installed directory 'C:/Program Files/R/R-2.14.1/library' not writeable
'Matrix' cannot be updated, installed directory 'C:/Program Files/R/R-2.14.1/library' not writeable
'mgcv' cannot be updated, installed directory 'C:/Program Files/R/R-2.14.1/library' not writeable
'nlme' cannot be updated, installed directory 'C:/Program Files/R/R-2.14.1/library' not writeable
'rpart' cannot be updated, installed directory 'C:/Program Files/R/R-2.14.1/library' not writeable
'survival' cannot be updated, installed directory 'C:/Program Files/R/R-2.14.1/library' not writeable

とエラーになる。
C:/Program Files/R/R-2.14.1/libraryのパーミッションエラーらしい。
対策:
①エクスプローラでlibraryのフォルダで右クリック
②libraryのプロパティーでセキュリティータグをクリック
③グループ名またはユーザー名でUsers(自分のユーザー)を選択
 Usersのアクセス許可でフルコントロールを選択し「適用」をクリック。


これで再度実行
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("graph")


インストールされた!!

参考:
 The R Tips―データ解析環境Rの基本技・グラフィックス活用集
 Rによるデータサイエンス - データ解析の基礎から最新手法まで
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